サービス概要

ACISS(Affinity-Constella In Silico Support)サービスは、創薬やその他関連分野における計算科学支援を目的として、当社と(株)京都コンステラ・テクノロジーズが共同で提供する受託研究・解析サービスです。両社のコア技術・各種ソフトウェアを組み合わせることにより、高速・高精度のインシリコスクリーニング、ターゲット予測、de novoデザイン、精密ドッキング解析等の計算業務実施や、またお客様のご要望に応じた最適なソフトウェア・システムの導入支援等、優れた費用対効果でトータルに創薬研究をサポートいたします。
本サービスの利用により、従来手法と異なるアプローチ、論理的な薬物設計が可能となり、新薬開発コストの縮減、開発期間の短縮が見込め、プロジェクトを効率的に進めることが可能となります。

コア技術

CGBVS 相互作用マシーンラーニング法:
既知相互作用情報を機械学習することにより、未知のタンパク-リガンドの相互作用を予測する計算手法です。標的タンパクの立体構造を必要とせず、化合物探索以外にターゲット予測や化合物デザインへの応用も可能です。京都大学開発の特許技術として、受託計算やシステム提供の他、スーパーコンピュータ「京」での実施例など多くの実績があります。
PBVS ファーマコフォアベース法:
生物学的活性を担うと考えられる化学的特徴の集合・空間配置(ファーマコフォア)を用いて、化合物データベースから医薬候補化合物をスクリーニングする手法です。ファーマコフォアモデルの構築には、標的タンパクの立体構造を利用する構造ベース、また活性化合物の構造式情報のみを利用するリガンドベースの2種類の方法を利用する事ができます。
SBVS ドッキングシミュレーション法:
標的タンパク質の立体構造モデル(PDB等)を用いて、標的タンパク質のポケットと化合物の結合様式をシミュレートすることにより、活性ポケットに結合する化合物を探索します。
LBVS 類似化合物探索法:
京都大学と京都コンステラ・テクノロジーズが共同開発した最新技術により、新規化合物のデザインを提供しています。フラグメントベース設計で生み出される化合物バリエーションをCGBVSで高速に評価し、さらにPSO(粒子群最適化)等の最適化アルゴリズムと組み合わせる事により、計算機の中で効率的に候補化合物を絞り込む事が可能です。

探索・最適化フェイズのサービス活用例


計算サービス基本メニュー

 シード探索
シード探索では、はじめに高速モードの探索計算(一次スクリーニング)で候補化合物を絞り込んだ後に本計算(二次スクリーニング)を実施する事で、効率的かつ高精度の探索が可能です。また、適用範囲が広く計算処理が速いCGBVSを他の手法と組み合わせることも有効です。



 標的タンパク予測
CGBVSによる標的タンパク質プロファイリング(GPCR, Kinase, Ion Channel, Nuclear Receptor, Transporter, Proteaseが対象)

 de novoデザイン
標的タンパク質に対して親和性を見込まれる化合物構造を一からデザイン(de novo design)し、側鎖や骨格の最適な組み合わせを効率的に探索する事が可能です。



 精密ドッキング
少数の化合物を対象に、精密なドッキングシミュレーションを実施します。

 ホモロジーモデリング
結晶構造が解明されていない標的に対して、高相同性タンパク質の立体構造を鋳型として用い、ドッキングシミュレーションのための立体構造モデルを構築します。



 CGBVS予測モデルのカスタム構築
社内アッセイデータ等を追加してCGBVSの予測モデルを再構築し、化合物探索計算の精度向上を図ることが可能です。



 化合物データベースの整備
社内化合物ライブラリのデータベース化作業などをお手伝いします(オンサイト作業可)。


料金体系

ACISSサービスのご提供価格は、「基本料金」+「個別計算料」の合計額となります。契約形態としては、年間契約とスポット契約(依頼毎の契約)のいずれかのパターンをご選択いただけます。

契約形態のパターン

個別計算の例

PBVS 高速ファーマコフォアスクリーニング <スポット契約 or 年間契約>
PBVS ファーマコフォアスクリーニング <スポット契約 or 年間契約>
SBVS 高速ドッキングスクリーニング <スポット契約 or 年間契約>
SBVS ドッキングスクリーニング <スポット契約 or 年間契約>
SBVS 精密ドッキング解析 <スポット契約 or 年間契約>
SBVS ホモロジーモデリング <スポット契約 or 年間契約>
CGBVS CGBVS化合物探索計算 <スポット契約 or 年間契約>
CGBVS CGBVS標的タンパク質予想計算 <スポット契約 or 年間契約>
CGBVS CGBVS予測モデル構築 <スポット契約 or 年間契約>
CGBVS de novoデザイン <スポット契約 or 年間契約>
LBVS リガンドベーススクリーニング <スポット契約 or 年間契約>

詳細は, 弊社営業部までお問い合わせください