アフィニティサイエンス | ilib diverse メイン

ilib diverse は、合理的なリード構造探索に適した drug-like な
有機化合物ライブラリを構築するためのフレキシブルなツールです。
ilib diverse を使用することで、コンピュータ上に短時間で高精度のバーチャル化合物ライブラリを作成することができます。

カスタマイズ可能なドラッグライブラリ

最新の化学的な知識に基づき、ユーザ定義フラグメントを組み合わせ、
化合物を構築することができます。
また、ユーザが調整可能な各種条件は、組み合わせて使用することができ、
構造に多様性を持たせたり、リード構造を改良したりすることができます。
モンテカルロ法は、いずれの方法にも良い結果を与えます。

フィルタリング機能

生成された化合物を化学的特性の最大値、最小値、分子量、clogP、トポロジカル極性表面積、回転結合、環構造の数、特定原子の出現数等により、フィルタリングすることができます。反応性のフィルタを使用することで、合成のし易さといったものも考慮することができます。

リファレンス

• Bretonnet, A.-S.; Jochum, A.; Walker, O.; Krimm, I.; Goekjian, P.; Marcillat, O.; Lancelin, J.-M.; NMR Screening Applied to the Fragment-Based Generation of Inhibitors of Creatine Kinase Exploiting a New Interaction Proximate to the ATP Binding SiteJ. Med. Chem.; 2007; 50(8); 1865-1875.
  • DOI: 10.1021/jm061460r

ilib diverse は、インシリコ創薬に役立つ、次のようなユニークな機能を提供しています。

コンテンツ

drug-like 分子の生成に適したフラグメントとターゲットを特化したライブラリサンプルが付属

高度なフィルタリング

• 定義済みフィルタ
  • Oral bio-availability (Veber, Fichert, Lipiski rule of 5, Palm)
  • BBB permeability (Murcko, Van de Waterbeemd)
  • Drug-likeness (Ghose, Lee, Mozziconacci, Oprea, Walters & Murcko)
  • Lead-likeness (Oprea)
• カスタマイズフィルタ
  • 原子、重原子、芳香族原子の数
  • 分子量
  • 回転結合の数
  • 環の数（SSSR）
  • LogP推算値
  • トポロジカル極性表面積（TPSA）
  • 水素結合のドナー、アクセプター数
  • 陰イオン、陽イオンの数
  • 原子出現数（窒素、酸素、ハロゲン）

グラフィカルユーザインターフェイス

GUIにより、初心者でもスムーズな操作が可能です。

CORINAの統合

3D立体構造を生成する場合、立体構造作成ソフトとして定評のあるMolecular Networks社製のCORINAをシームレスに統合することができます。（※オプション扱いとなり、CORINAのライセンスが別途必要です）

高速

フィルタ設定にもよりますが、標準的なPCで、毎分最大15,000化合物を生成することが可能です。

柔軟性

フラグメントとフィルタ設定は、カスタマイズ可能で、重みづけの調整や、複数の条件を組み合わせて利用することができます。

互換性

ライブラリをSMILESやSDFファイル形式で書き出すことができるので、構築したライブラリを外部の環境で利用することができます。

Windows

Linux

• glibc 2.2以降
• OpenGL必須

Unix（Irix, Solaris, AIX）

• Java 1.4.02以降
• Java3D 1.3.1以降

重要：ilib diverseはダウンロード版のみのご提供となります. ご注文時にご登録いただいた電子メールアドレス宛に、ダウンロードサイトの情報が, 開発元より直接連絡されます.