LigandScout Main Program Features

主な機能

アドバンテージと機能

• ジオメトリ、辞書およびルールを用いたリガンドの自動認識
• 高度な3D描画機能とアンドゥ機能を備えた最新鋭のユーザインターフェイス
• 3Dインターフェイスと連携した2Dビューと階層ビュー
• タンパク質-リガンド相互作用の2D表示
• 化合物ライブラリの検査のためのライブラリビュー（プロパティ、スコア計算、アライメント）
• 複数のリガンドとファーマコフォアから、作用機構を評価可能な共通ファーマコフォアを作成
• 補因子、イオン、水分子、金属結合位置（Fe, Mg, Zn）の高度な取扱い
• ドッキング結果の表示、ドッキングポーズからファーマコフォアを作成
• Catalyst/DiscoveryStudio^tm、MOE^tm、Phase^tmへのファーマコフォアエクスポート機能
• ファーマコフォアベースの分子アライメント
• 活性部位でのモデリング時にリガンドの容易な手動修正が可能
• 水分子および補因子をリガンドの一部、または高分子の一部として扱うことが可能
• MMFF94力場によるリガンド分子の構造最適化
• 熟練ユーザ向けの豊富なパラメータ調整機能
• 無制限のアンドゥレベル
• 多数の分子ファイル形式と画像ファイル形式をサポート
• 結合部位、分子、ファーマコフォアを格納するための、優れたファイルおよびリポジトリ管理機能