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LigandScout
Advanced Pharmacophore Modeling
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LigandScout 2.0
LigandScoutは、高分子/リガンドの複合体構造から、3次元ファーマコフォア（薬理作用団）を
高速にかつユーザの手を煩わせることなく求めることができるソフトウェアツールです。
LigandScoutが採用しているアルゴリズムは、論文で公表されており[1-4]、
数年間に及ぶファーマコフォア生成の経験に基づいています。
また、その一方で、アプリケーションは最新の情報技術を取り入れています。
一般的なファーマコフォア形式を各種サポートしており、
スクリーニング用プラットフォームとの優れた相互運用が可能です。
マルチアンドゥ機能を備えたフル機能の3Dグラフィカルユーザインターフェイスを用いて、
活性部位の探索や複合体のファーマコフォア生成を効率よく行うことができます。
LigandScoutが提供する結合部位解析、ファーマコフォアに基づいたアライメント、
共通ファーマコフォアの作成といった機能を、バーチャルスクリーニングと組み合わせることで、
構造ベースの薬物設計において欠かせないツールとなっています。
LigandScoutは、一般的な全てのオペレーティングシステム上で動作します。
- Wolber, G.; Dornhofer, A. A.; Langer, T.; Efficient overlay of small organic molecules using 3D pharmacophores
J. Comput. Aided Mol. Des.; 2007; 20(12); 773-788.
DOI: 10.1007/s10822-006-9078-7
- Wolber, G.; Langer, T.; LigandScout: 3-D Pharmacophores Derived from Protein-Bound Ligands and Their Use as Virtual Screening Filters.
J. Chem. Inf. Model; 2005; 45(1); 160-169.
DOI: 10.1021/ci049885e (request reprint)
- Wolber, G.; Kirchmair H.; Langer, T.; Structure-Based 3D Pharmacophores: An Alternative to Docking?
Plenary talk at the 7th International Conference on Chemical Structures in Noordwijkerhout, 2005
プレゼンテーション用PDF [2.8 MB] ダウンロード
- Wolber G., Dornhofer A. A., Langer T.; Efficient Overlay of Molecular 3D Pharmacophores. Oral presentation at the spring ACS meeting in Atlanta, GA, USA, 2006
プレゼンテーション用PDF [8.8 MB] ダウンロード
