Pharmacophore Database High Quality Pharmacophore Collection for Activity Profiling

Inte:Ligand ファーマコフォアデータベースは、使い勝手のよい自動化された方法によって、 化合物構造からリガンドプロファイルを高速かつ直感的に導出可能なツールです。

Inte:Ligand社製ファーマコフォアデータベースには、化学的特徴に基づいた 高品位の3Dファーマコフォアが多数収録されています。 このデータベースは、数年間に及ぶファーマコフォア作成の経験をベースに、 マニュアルで構築されており、慎重な検証がなされています。 データベースには、生物活性を有する有機分子の構造データからだけでなく、 タンパク質-リガンド複合体の立体構造から求めたモデルも含まれています。 各エントリのメタデータは、医学的適応、薬効分類、標的タンパク質、相互作用部位、 生物活性リガンド、参考文献に関する情報をカバーする内容になっています。

現在、パラレルバーチャルスクリーニング用に2500以上のファーマコフォアモデルを 利用することができます。それらは、主要な薬効分類に由来した、臨床的に意義のある ユニークな300の薬理学的標的を対象としています。 この薬効分類には、例えば、抗感染、心臓血管、内分泌、胃腸、免疫、代謝、神経、 腫瘍溶解、腎臓-泌尿器、呼吸器系薬剤に加え、hERGおよびシトクロムP450ファミリの メンバー等のアンチターゲットが含まれています。

Catalyst(tm)およびDiscoveryStudio/PipelinePilot環境で利用でき、 既存の標準的なワークフローにシームレスに統合することができます。

リファレンス:

• Parallel Screening: A Novel Concept in Pharmacophore Modelling and Virtual Screening T. M. Steindl, D. Schuster, C. Laggner, T. Langer J. Chem. Inf. Model., 46, 2146-2157 (2006)
  DOI 10.1021/ci6002043
• High Throughput Structure-based Pharmacophore Modeling as A Basis for Successful Parallel Virtual Screening T. M. Steindl, D. Schuster, G. Wolber, C. Laggner, T. Langer J. Comput. Aided Mol. Des., 20, 703-715 (2006)
  DOI 10.1007/s10822-006-9066-y
• Parallel Screening and Activity Profiling with HIV Protease Inhibitor Pharmacophore Models T. M. Steindl, D. Schuster, C. Laggner, K. Chuang, R. Hoffmann, T. Langer J. Chem. Inf. Model., 47, 563-571 (2007)
  DOI 10.1021/ci600321m
• Pharmacophore Modeling and Parallel Screening for PPAR Ligands P. Markt, D. Schuster, J. Kirchmair, C. Laggner, T. Langer J. Comput. Aided Mol. Des. 21, 575-590 (2007)
  DOI 10.1007/s10822-007-9140-0