ChromasPro

数百万塩基のアセンブリ及び配列編集・解析が可能なDNAシークエンシング用ソフトウェア

製品概要

ChromasProは、数百万塩基規模のアセンブリおよび基本的な配列編集・解析が可能なDNAシークエンシング用ソフトウェアです。 ABI社(サンガーシーケンサー)や454Life Sciences社、Illumina社(次世代シーケンサー)などのシーケンス・データをアセンブリすることができます。RAM 8GBを使用する場合、最大100万シーケンスをアセンブリすることが可能です。

開発元:オーストラリア Technelysium Pty Ltd

主な機能

・読み込み可能なファイル形式(Applied Biosystems .ab1、Staden Chromatogram (SCF及びZTR)、454 SFF、FASTA、FASTQ、EMBL、GenBank、SwissProt、GenPept、GCG RSF 及びプレーンテキスト形式)

・出力可能なシーケンスファイル形式(.ab1、.scf、.fasta、.fastq)

・重複配列を用いたコンセンサス配列の生成、あいまい部分の強調表示

・クオリティデータを使用して、低品質シーケンスの自動削除、アセンブリ改善

・レファレンス配列をアセンブリのためのスキャフォールド配列として使用可能

・制限酵素切断地図とフラグメントマップ作成、切断(カッター)、ノンカッター、フラグメントのリスト機能

・G + Cフレームプロットによるオープンリーディングフレームのマッピング、ORFのワンクリック変換

・クロマトグラム、制限酵素認識部位とフラグメントマップ、オープンリーディングフレームマップの印刷機能

・NCBI Webサイトを利用したヌレオチドおよびタンパク質BLAST検索

・ClustalW用インターフェースによるマルチプルアライメント

・シーケンスとクロマトグラムの反転と補完

・完全一致または最適アライメントによるシーケンス検索

・ヌクレオチド配列編集時に翻訳アミノ酸配列の表示

・逆翻訳の実行及びヌクレオチド縮重のプロット

・タンパク質の親水性と抗原性をプロット

・クロマトグラムセクションの画像コピー機能(ドキュメントやプレゼンテーション資料へのペースト用)

 

対応OS

◎Windows (XP、Vista、7、8.1、10)

 

無償評価ライセンス

14日間無償でご利用いただける評価ライセンスをご提供可能です。

ご希望の場合、こちらのフォームから申請いただくか、営業担当までお問い合わせください。

 

価格情報

 

標準(一般向けライセンス)

種類 価格(税抜)
シングルユーザー
永久ライセンス
¥37,000~

 

アカデミック(大学)

種類 価格(税抜)
シングルユーザー
永久ライセンス
¥18,000~

 

※価格は為替変動等により変化し、また予告なく変更される場合があります。

※マルチユーザーライセンスをはじめ、複数のライセンス形態がございます。詳しくはお問合せください。

 

関連ソフトウェア:Chromas

Chromasは無料で利用可能なトレースビューアです。

 

Chromas主な機能

・.ab1、SCF・ZTR形式のクロマトグラムファイルの読み込み

・.ab1、.scf形式でのシーケンス保存

・クロマトグラムの拡大・縮小印刷

・低品質のシーケンス(クオリティデータがある場合)またはベクターシーケンスの自動削除

・FASTA、FASTQ、EMBL、GenBank、GCG形式及びプレーンテキスト(塩基ナンバリングオプション)による書き出し

・シーケンスデータ(プレーンテキスト、FASTAまたはFASTQ形式)のクリップボード・コピー機能

・シーケンスとクロマトグラムの反転と補完

・完全一致または最適アライメントによるサブシーケンス検索

・シーケンスに加えて翻訳アミノ酸配列の表示

・クロマトグラムセクションの画像コピー機能(ドキュメントやプレゼンテーション資料にペースト用)

・フォーマット変換、ベクトル削除を伴うシーケンスや生データのエクスポート、印刷等のバッチ処理機能

・PeakTrace(別オプション)用インターフェイスによる高品質ベースコール機能

公開日:2020/02/14
最終更新日:2020/06/22