CADDLE / SAR-caddle
CADDLE:Webベースの分子モデリングシステム/SAR-caddle:SARモデル構築・適用ソフトウェア
CADDLE

製品概要
CADDLEは、Cepos InSilico GmbHとMOLCAD GmbHの共同開発によるWebベース(インストール不要)の分子モデリングシステムです。分子構造入力ソフト2D skechersと分子軌道計算ソフトEMPIREが付属し、WebGLを用いた高品質な3D結果表示とインタラクティブな操作が可能です。個々のプロジェクトや計算をリスト表示し、高度で柔軟なワークフローやプロトコルを組み合わせたモデリングタスクを実行できます。
※CADDLEにはEMPIREのシングルノードバージョンが含まれています。
開発元: CEPOS INSILICO GmbH
開発元: MOLCAD GmbH
【関連製品】
- Cepos Suite
-
EMPIRE(+EH5cube)+ParaSurf+CImatchのセット商品
- EMPIRE
-
大規模な系に適用可能な並列半経験的分子軌道法ソフトウェア
ページはこちら
- CImatch
-
標準等密度面と局所特性に基づいて分子の重ね合わせ計算を行うソフトウェア
ページはこちら
- ParaSurf
-
分子表面を構築し局所的な特性と記述子を計算する基本モジュール
ページはこちら
- SAR-caddle
-
エクセルファイルを入力データとして使用できるQSAR/QSPRモデルの構築と適用のためのWebベースソフトウェア
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主要な機能
-
管理者によるユーザ管理
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プロジェクトのリスト管理と共有
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付属ソフト2D sketcherを用いて作成した分子構造の使用
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付属ソフトEMPIREを用いた計算
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計算結果のリスト管理
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WebGLを用いた結果の3D表示とインタラクティブな操作
- 対応ファイル形式
-
入力 : Structure Data File(.sdf)/ SMILES(.smi) / 2D sketcher経由
-
出力 : EMPIRE独自形式ファイル (.zip)(.log/.vwf/.sdf/.h5ファイルを含む)
技術情報
- CADDLE2.0 ユーザマニュアル(開発元サイト; 英語)
- EMPIRE20 ユーザマニュアル(開発元サイト; 英語)
バージョン情報
- バージョン2.0(2021年3月31日リリース)
動作環境
- 対応OS(サーバ)
-
Windows / Linux
- 対応ブラウザ(クライアント)
-
- PC
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Microsoft Edge / Google Chrome 9以降 / Firefox / Safari 5.1以降 (Mac OS 10.6以降のみ)
※SafariはWindows非対応です。
- モバイル
-
iOS 8以降 / Google Chrome / Firefox
ライセンス形態
- ユーザ種別
-
一般用
-
アカデミック (※サポートは含まれておりません)
- 注意事項
-
※ご所属一括での契約となるSiteライセンスです。
-
※年間契約となり毎年更新が必要です。
- 使用許諾条件について
-
ライセンスの詳細につきましては、使用許諾条件をご確認ください。
価格情報
CADDLEのライセンス価格は、一般用とアカデミック用で異なります。ユーザーライセンス形態と価格については、お問い合わせフォームからお問い合わせいただくか、弊社営業までお問い合わせください。
商品名 | 価格 |
---|---|
CADDLE Site | お問い合わせください |
CADDLE Site 教育用 | お問い合わせください |
※全てのライセンスは毎年更新が必要です。
SAR-caddle
製品概要
SAR-caddleはCepos InSilico GmbHとMOLCAD GmbHの共同開発によるWebベース(インストール不要)のSAR/SPRモデルの構築ソフトウェアです。標準エクセル形式のデータに対応し、初期自動解析によりデータの適正化を行います。領域解析と3D可視化ツールを備えています。
開発元: CEPOS INSILICO GmbH
開発元: MOLCAD GmbH
【関連製品】
- Cepos Suite
-
EMPIRE(+EH5cube)+ParaSurf+CImatchのセット商品
- EMPIRE
-
大規模な系に適用可能な並列半経験的分子軌道法ソフトウェア
ページはこちら
- CImatch
-
標準等密度面と局所特性に基づいて分子の重ね合わせ計算を行うソフトウェア
ページはこちら
- ParaSurf
-
分子表面を構築し局所的な特性と記述子を計算する基本モジュール
ページはこちら
- CADDLE
-
高品質3D表示が可能なWebベースの分子モデリングシステム(EMPIREのシングルノードバージョンを含む)
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主要な機能
-
- 高性能ライブラリを用いたモジュール計算
- SAR-caddleサーバ上での計算
- 初期自動解析によるデータの適正化
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-
不正データのチェック
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同一データや矛盾データポイントの除去
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データ分布の確認
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相関行列の計算と高い相関を持つ記述子の組の一方を削除
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主成分解析による記述子の固有次元の決定
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- モデル構築
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- 独自のtraffic lightシステムによる、データや記述子の適正チェック
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記述子のバイアスを考慮して定義された臨界F値を用いた段階的回帰
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committe-machines手法
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シェパード補間
- データの可視化とインタラクティブな操作
-
-
記述子相関の2D散布図
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色別の3D散布図
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- 対応ファイル形式
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入力 : エクセル形式ファイル(.xls/.xlsx) あるいはタブかコンマで区切られたデータ
技術情報
- SAR-caddle 仕様書(開発元サイト; 英語)
バージョン情報
- バージョン1.0(2012年8月21日リリース)
動作環境
- 対応OS(サーバ)
-
Windows / Linux
- 対応端末(クライアント)
-
※URLにアクセスできる全てのデバイス
デスクトップPC / ノートPC / スマートフォン / タブレット
ライセンス形態
- ユーザ種別
-
一般用
-
アカデミック (※サポートは含まれておりません)
- 注意事項
-
※ご所属一括での契約となるSiteライセンスです。
-
※年間契約となり毎年更新が必要です。
- 使用許諾条件について
-
ライセンスの詳細につきましては、使用許諾条件をご確認ください。
価格情報
SAR-caddleのライセンス価格は、一般用とアカデミック用で異なります。ユーザーライセンス形態と価格については、お問い合わせフォームからお問い合わせいただくか、弊社営業までお問い合わせください。
商品名 | 価格 |
---|---|
SAR-caddle Site | お問い合わせください |
SAR-caddle Site 教育用 | お問い合わせください |
※全てのライセンスは毎年更新が必要です。
最終更新日:2023/01/12