CADDLE：Webベースの分子モデリングシステム／SAR-caddle：SARモデル構築・適用ソフトウェア

CADDLE

製品概要

CADDLEは、Cepos InSilico GmbHとMOLCAD GmbHの共同開発によるWebベース（インストール不要）の分子モデリングシステムです。分子構造入力ソフト2D skechersと分子軌道計算ソフトEMPIREが付属し、WebGLを用いた高品質な3D結果表示とインタラクティブな操作が可能です。個々のプロジェクトや計算をリスト表示し、高度で柔軟なワークフローやプロトコルを組み合わせたモデリングタスクを実行できます。

※CADDLEにはEMPIREのシングルノードバージョンが含まれています。

開発元： CEPOS INSILICO GmbH

開発元： MOLCAD GmbH

【関連製品】

Cepos Suite

EMPIRE(+EH5cube)+ParaSurf+CImatchのセット商品

EMPIRE

大規模な系に適用可能な並列半経験的分子軌道法ソフトウェア

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CImatch

標準等密度面と局所特性に基づいて分子の重ね合わせ計算を行うソフトウェア

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ParaSurf

分子表面を構築し局所的な特性と記述子を計算する基本モジュール

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SAR-caddle

エクセルファイルを入力データとして使用できるQSAR/QSPRモデルの構築と適用のためのWebベースソフトウェア

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主要な機能

管理者によるユーザ管理

プロジェクトのリスト管理と共有

付属ソフト2D sketcherを用いて作成した分子構造の使用

付属ソフトEMPIREを用いた計算

計算結果のリスト管理

WebGLを用いた結果の3D表示とインタラクティブな操作

対応ファイル形式

入力 : Structure Data File（.sdf）/ SMILES(.smi) / 2D sketcher経由

出力 : EMPIRE独自形式ファイル (.zip)(.log/.vwf/.sdf/.h5ファイルを含む)

 

技術情報

• CADDLE2.0 ユーザマニュアル（開発元サイト; 英語）
• EMPIRE20 ユーザマニュアル（開発元サイト; 英語）

 

バージョン情報

• バージョン2.0（2021年3月31日リリース）

 

動作環境

対応OS(サーバ)

Windows / Linux

対応ブラウザ(クライアント)

PC

Microsoft Edge / Google Chrome 9以降 / Firefox / Safari 5.1以降 (Mac OS 10.6以降のみ)

※SafariはWindows非対応です。

モバイル

iOS 8以降 / Google Chrome / Firefox

 

ライセンス形態

ユーザ種別

一般用

アカデミック (※サポートは含まれておりません)

注意事項

※ご所属一括での契約となるSiteライセンスです。

※年間契約となり毎年更新が必要です。

使用許諾条件について

ライセンスの詳細につきましては、使用許諾条件をご確認ください。

 

価格情報

CADDLEのライセンス価格は、一般用とアカデミック用で異なります。ユーザーライセンス形態と価格については、お問い合わせフォームからお問い合わせいただくか、弊社営業までお問い合わせください。

 

商品名	価格
CADDLE Site	お問い合わせください
CADDLE Site 教育用	お問い合わせください

 

※全てのライセンスは毎年更新が必要です。

 

SAR-caddle

 

製品概要

SAR-caddleはCepos InSilico GmbHとMOLCAD GmbHの共同開発によるWebベース（インストール不要）のSAR/SPRモデルの構築ソフトウェアです。標準エクセル形式のデータに対応し、初期自動解析によりデータの適正化を行います。領域解析と3D可視化ツールを備えています。

開発元： CEPOS INSILICO GmbH

開発元： MOLCAD GmbH

【関連製品】

Cepos Suite

EMPIRE(+EH5cube)+ParaSurf+CImatchのセット商品

EMPIRE

大規模な系に適用可能な並列半経験的分子軌道法ソフトウェア

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CImatch

標準等密度面と局所特性に基づいて分子の重ね合わせ計算を行うソフトウェア

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ParaSurf

分子表面を構築し局所的な特性と記述子を計算する基本モジュール

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CADDLE

高品質3D表示が可能なWebベースの分子モデリングシステム(EMPIREのシングルノードバージョンを含む)

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主要な機能

高性能ライブラリを用いたモジュール計算

SAR-caddleサーバ上での計算

初期自動解析によるデータの適正化

不正データのチェック

同一データや矛盾データポイントの除去

データ分布の確認

相関行列の計算と高い相関を持つ記述子の組の一方を削除

主成分解析による記述子の固有次元の決定

モデル構築

独自のtraffic lightシステムによる、データや記述子の適正チェック

記述子のバイアスを考慮して定義された臨界F値を用いた段階的回帰

committe-machines手法

シェパード補間

データの可視化とインタラクティブな操作

記述子相関の2D散布図

色別の3D散布図

対応ファイル形式

入力 : エクセル形式ファイル(.xls/.xlsx) あるいはタブかコンマで区切られたデータ

 

技術情報

• SAR-caddle 仕様書（開発元サイト; 英語）

 

バージョン情報

• バージョン1.0（2012年8月21日リリース）

 

動作環境

対応OS(サーバ)

Windows / Linux

対応端末(クライアント)

※URLにアクセスできる全てのデバイス

デスクトップPC / ノートPC / スマートフォン / タブレット

 

ライセンス形態

ユーザ種別

一般用

アカデミック (※サポートは含まれておりません)

注意事項

※ご所属一括での契約となるSiteライセンスです。

※年間契約となり毎年更新が必要です。

使用許諾条件について

ライセンスの詳細につきましては、使用許諾条件をご確認ください。

 

価格情報

SAR-caddleのライセンス価格は、一般用とアカデミック用で異なります。ユーザーライセンス形態と価格については、お問い合わせフォームからお問い合わせいただくか、弊社営業までお問い合わせください。

 

商品名	価格
SAR-caddle Site	お問い合わせください
SAR-caddle Site 教育用	お問い合わせください

 

※全てのライセンスは毎年更新が必要です。