ACEMD Platform chronicle-admin 材料科学関連創薬科学関連ACEMD Platformは分子動力学シミュレーションのために設計された、完全で高速なソリューションパッケージです。
Advance/NanoLabo shiomi 材料科学関連Advance/NanoLaboは第一原理計算・分子動力学計算コード(Quantum ESPRESSO、LAMMPSなど)がビルトインされた統合GUI・ナノ材料解析ソフトウェアです。
alvaDesc shiomi 材料科学関連創薬科学関連alvaDescは6000種近くの分子記述子、4種(PFP/ECFP/ECFPV3/MACCS166)のフィンガープリントと構造パターンを計算可能なソフトウェアです。
alvaModel/alvaRunner chronicle-editor 材料科学関連創薬科学関連alvaModelは定量的構造活性/特性相関(QSAR/QSPR)モデルの作成を行うソフトウェアです。alvaRunnerではalvaModelの作成モデルを基に計算を行います。
alvaMolecule shiomi 材料科学関連創薬科学関連alvaMoleculeは分子データセットを分子グリッドもしくはスプレッドシートとして可視化し、分析キュレート及び標準化を行うソフトウェアです。
CADDLE / SAR-caddle chronicle-editor 材料科学関連創薬科学関連CADDLE:Webベースの分子モデリングシステム/SAR-caddle:SARモデル構築・適用ソフトウェア
ChromasPro shiomi 創薬科学関連ChromasProは数百万塩基規模のアセンブリと基本的な配列編集・解析が可能なDNAシークエンシング用ソフトウェアです。Chromasは無料で利用可能です。
Dragon[重要] 2019年6月末をもちまして販売を終了いたしました。 shiomi 創薬科学関連Dragon 7(2019年6月に販売を終了)は最大5,270の分子記述子を計算でき、QSAR、スクリーニング、機械学習等に利用可能なソフトウェアです。
Molecular Conceptor shiomi 創薬科学関連Molecular Conceptorは医薬品化学、薬物設計、分子モデリングおよびケムインフォマティクスを学習、指導するためのマルチメディア教材です。
PharmacophoreDB shiomi 創薬科学関連PharmacophoreDBは化合物構造からリガンドプロファイルを迅速かつ容易に得ることが可能な、10,000を超えるファーマコフォアモデルを含むツールです。
SIESTA[重要] 2016年リリースのバージョン4.0よりGPLライセンス(オープンソース)で提供されています。 shiomi 材料科学関連SIESTAは密度汎関数法(DFT)による電子構造計算と分子・結晶の第一原理分子動力学シミュレーションを目的として開発されたソフトウェアです。
YASARA shiomi ソフトウェア創薬科学関連YASARAは生体高分子向けの汎用モデリング・解析ソフトです。分子動力学計算、タンパクモデリング、低分子ドッキング、マクロ作成機能など多くの用途に利用可能です。